Die Vaginalflora wird im Laufe des Lebens stark durch hormonelle Veränderungen beeinflusst. Darüber hinaus ist sie während der Menstruation und nach ungeschütztem Geschlechtsverkehr am instabilsten. Während dieser Zeit nimmt der pH-Wert zu und es kann leicht zu einer übermässigen Vermehrung von Krankheitserregern kommen. Die Störung der Vaginalflora bezeichnet man als Vaginitis. Die häufigsten Formen der Vaginitis sind die Vaginalmykose und die bakterielle Vaginose.